Roche uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm Kullanım kılavuzu

Marka: Roche

Modeli: uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm

Tip: Kullanım kılavuzu

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücreli

Olmayan Akciğer Kanseri için görüntü

analizi Algoritma Kılavuzu

İçindekiler

Giriş 1

Algoritma Özeti ve Açıklaması 2

Kullanım Amacı 3

Ürünün Kullanım Amacı 3

Algortma Kılavuzunun Amacı 3

Klinik Önemi 4

Test Prensipleri 5

Sınırlamalar 6

Veri Güvenliği 7

uPath PD-L1 NSCLC için görüntü analizi Algoritması kullanımına

yönelik iş akışı 8

Patolog İş Akışı 9

PD-L1 Görüntü Analz 12

PD-L1 Değerlendrmes 15

PD-L1 Algortması Boyama Değerlendrmes 15

Boyama Özellikleri 15

Performans Özellikleri 26

Yöntem Karşılaştırması 26

Patolog Yenden Üretleblrlk Çalışmaları 27

Tarayıcı Yenden Üretleblrlk Çalışmaları 28

Sorun giderme 29

Referanslar 33

Giriş

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser

(Non-Small Cell Lung Cancer, NSCLC) çn görüntü analz

algortmasına (uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortması) sahp Roche uPath enterprse software (uPath

enterprse software), formalnle fkse edlp parafne gömülmüş

(formaln-fxed, paraffn-embedded, FFPE) normal ve neoplastk

dokulardan alınan mmünohstokmyasal (mmunohstochemcal,

IHC) olarak boyanmış hstolojk kestlerdek proten

ekspresyonunun kanttatf değerlendrmesnde yardımcı olmak

üzere tasarlanmış br yazılım sstemdr.

uPath enterprse software, patoloj laboratuvarlarının, patoloj

numunelernn djtal görüntülern almasına, yönetmesne,

görüntülemesne, analz etmesne, paylaşmasına ve raporlamasına

olanak sunan br uçtan uca djtal patoloj yazılım çözümüdür.

Patolog, uPath enterprse software yazılımını kullanarak, djtal

görüntüler çeştl büyüklüklerde göreblr, notlar atayablr, doku

kest ölçümler yapablr, görüntü analz yapablr ve raporlar

oluşturablr.

Not: uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

IHC olarak boyanmış doku numunelernn mkroskop cam

slaytlarından görüntülern elde edlmes ve PD-L1 protennn

varlığı bakımından ölçülmesnde yardımcı olma amaçlı, brleşk

br blgsayar destekl metodolojdr. Görüntü analz skorlarının

geçerllğnden emn olmak amacıyla VENTANA PD-L1 (SP263)

Rabbt Monoclonal Prmary Antbody yöntem belgesnde

(www.ventana.com adresnde mevcuttur) belrtldğ şeklde

uygun kontroller kullanarak uyumu doğrulamak patoloğun

sorumluluğundadır.

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 1

2 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Algoritma Özeti ve Açıklaması

Patolog, görüntü analz uygulamalarında, br veya brkaç

lglenlen bölgey (ROI) seçmek ve öne çıkarmak çn uPath

enterprse software yazılımını kullanablr ve her br ROI, çeştl

büyüklüklerde görüntüleneblr ve ardından, uPath PD-L1

(SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması tarafından

analz edleblr. Toplam hedef TC sayımı oluşturulur ve tümör

hücreler (tumor cells, TC) boyanmış olup olmadıklarına bağlı

olarak katmanlı hale getrlrler. uPath PD-L1 (SP263) NSCLC

çn görüntü analz algortması, %0-100 ölçeğnde PD-L1 TC

Poztﬂk skorunu oluşturmak çn boyanmış TC'y toplam TC

sayısına (boyanmış ve boyanmamış) böler. uPath PD-L1 (SP263)

NSCLC çn görüntü analz algortması, belrl br ROI'ye yönelk

br skor veya lgl slaytta bulunan tüm seçl ROI'ler çn toplu br

skor oluşturablr. Her ne kadar algortma, tümör dışı hücreler

genel analzn br parçası olarak saptasa da, kaplama ve çıktı

yalnızca TC Poztﬂk puanının hesaplanmasında kullanılan TC'y

gösterr. Patolog, uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü

analz algortmasının sağladığı skoru kabul edeblr veya farklı

br skor le bu skoru geçersz kılablr. Patolog algortmanın neler

poztf ve negatf TC olarak şaretledğn dkkatle ncelemel ve

algortmanın doğru olduğunu onaylamalı veya manuel geçersz

kılma gerçekleştrmeldr. uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn

görüntü analz algortması verlere yönelk bağımsız yorumlamalar

oluşturmaz ve dolayısıyla yalnızca hstolojk tetkk, lgl klnk

blgler ve uygun kontroller le brlkte kalfye br patolog

tarafından kullanılmalıdır. Patoloğa, %50 düzeynde PD-L1

ekspresyonu değerlendrmesnde yardımcı olarak tasarlanmıştır

ve bu yönde kullanımı endkedr.

Kullanım Amacı

Algortma Kılavuzunun Amacı

Bu uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz Algortma

Kılavuzu (Algortma Kılavuzu) belgesnn amaçları aşağıda

belrtlmektedr:

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortmasının kullanım amacı, test prenspler ve sınırlamaları

hakkında ön blg sağlamak.

• Gerekl materyaller ve BT, ver güvenlğ ve ağ gerekllklern

oluşturmak.

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortmasını

çalıştırmaya yönelk adım adım talmatlar sunmak.

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortmasının nasıl kullanılması gerektğne dar fotoğrafk

görüntüler sağlamak.

• Patologlara, VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le boyanmış

FFPE NSCLC kestlernde uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn

görüntü analz algortması kullanımını kolaylaştırmaya yönelk

br araç sağlamak.

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortmasının

değerlendrme amacıyla nasıl kullanılacağına dar rehberlk

sağlamak çn zorlu vakaların örnek görüntülern sunmak.

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortmasının performans özellklern göstermek.

Ürünün Kullanım Amacı

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn Görüntü Analz algortmasının,

formalnle fkse edlp parafne gömülmüş NSCLC dokusundak

PD-L1 protennn tespt edlmes ve yarı kanttatf ölçümünde

patoloğa yardımcı olması amaçlanmıştır. VENTANA PD-L1

(SP263) Assay le brlkte kullanıldığında onaylı terapötk ürün

etketlemes uyarınca ≥ %50 PD-L1 TC poztﬂk kesme noktasına

sahp teraplerle tedavye yönelk olarak NSCLC hastalarının

saptanmasında kullanım çn endkedr.

Not: uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn Görüntü Analz Algortması,

IHC olarak boyanmış doku numunelernn mkroskop cam

slaytlarından görüntülern elde edlmes ve PD-L1 protennn

varlığı bakımından ölçülmesnde yardımcı olma amaçlı, brleşk

br blgsayar destekl metodolojdr. Görüntü analz skorlarının

geçerllğnden emn olmak amacıyla VENTANA PD-L1 (SP263)

Assay yöntem belgesnde (P/N 741-4905) belrtldğ şeklde

uyumu doğrulamak ve uygun kontroller kullanmak patoloğun

sorumluluğundadır.

Bu algortma, in vitro tanı amaçlı (in vitro dagnostc, IVD)

kullanıma yönelktr.

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 3

Klinik Önemi

Akcğer kanser yıllardır dünyadak en yaygın kanser türüdür ve

dünya çapında kanserle lşkl br numaralı ölüm nedendr. Tüm

yen kanser vakalarının %12,9'unu oluşturduğu ve tüm dünyada

yılda 1,76 mlyon cvarında ölümden ya da yaklaşık olarak

beş kanser kaynaklı ölümün brnden sorumlu olduğu tahmn

edlmektedr. Tüm akcğer kanser vakalarının yaklaşık %85'n

oluşturan NSCLC, en sık rastlanan akcğer kanser türüdür.

NSCLC hastalarının çoğu cerrah uygulanamayan, lokal olarak

lerlemş br hastalığa (Evre IIIB) veya metastatk hastalığa (Evre

IV) sahptr ve k hastalık çn de şu anda küratf tedav seçeneğ

yoktur. İler evrelerde teşhs edlmş NSCLC çn 5 yıl görel

sağkalım oranı %4,7'dr.

Programlı ölüm lgandı 1 (PD-L1), aktve edlmş T hücrelernde

eksprese olan ve programlı ölüm 1 (PD-1) ve B7-1 (CD80) olmak

üzere k nhbtör reseptörüne bağlanarak mmün yanıtı düşürme

yoluyla düzenleyen br transmembran protendr. PD-L1'n PD-1 le

bağlanması T hücre prolferasyonunu, stokn üretmn ve stoltk

aktvtey nhbe ederek T hücrelernn fonksyonel naktvasyonuna

veya tükenmesne yol açar. PD-L1 aynı zamanda antjen sunucu

hücreler ve aktve edlmş T hücreler üzernde CD80'e bağlanarak

T hücre aktvasyonu ve stokn üretmnn nhbsyonu dahl

olmak üzere mmün yanıtların düşürülmesne aracılık edeblr.

PD-L1 ekspresyonu mmün hücreler ve TC'de gözlemlenr.  TC

üzernde anormal PD-L1 ekspresyonunun ant-tümör bağışıklığı

engelleyerek mmün kaçışa neden olduğu rapor edlmştr. 

PD-L1 / PD-1 yolunu kesntye uğratan mmünoteraplern

ortaya çıkışının NSCLC teşhs konulan hastalar çn sağkalım

oranlarını yleştrdğ gösterlmştr. Bununla beraber tedavyle

prognoz PD-L1 ekspresyonu sevyesne bağlıdır ve dolayısıyla

mmünohstokmyasal boyama le PD-L1 kantfkasyonu gerektrr.

İmmünohstokmya, doku örneklernde bulunan belrl antjenler

tespt etme amacıyla kullanılablr ve dolayısıyla, patologların

karsnom teşhs ve prognozlarında etkl br araçtır. VENTANA PD-

L1 (SP 263) Assay, FFPE normal ve neoplastk doku kestlernde

PD-L1 protennn yarı kanttatf tespt çn laboratuvarda

kullanıma yönelk br tavşan monoklonal antkorudur. Hstolojk

doku preparatlarının avantajlarından br de, ntakt dokunun

hasta örneğndek PD-L1 poztﬂğnn yorumlanmasına yardımcı

olacak morfolojye sahp olmasıdır. Tüm hstolojk testler, NSCLC

morfolojs ve/veya patoloj alanında br uzman tarafından

yorumlanmalıdır. Sonuçlar, morfolojk çalışmalar ve uygun

kontrollerle desteklenmel ve dğer klnk ve laboratuvar verleryle

brlkte kullanılmalıdır.

4 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Test Prensipleri

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması

özellğne sahp uPath enterprse software, TC Poztﬂk skoru elde

etmek çn görüntü analz teknklernden faydalanır.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le boyanmış dokunun görüntülern

skorlamak üzere önceden tanımlanmış parametreler kullanır.

Görüntü analizinde uygulanan adımlar:

• Beyaz boşluk tespt ve otomatk analzden harç tutma.

• Görüntünün tamamındak hücrelern tespt edlmes.

• Hücrelern TC veya başka hücre tpler olarak sınıﬂandırılması.

• Boyanmış ve boyanmamış TC tespt.

• VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belges uyarınca

boyanmış TC sayısının toplam TC sayısına bölünmesyle TC

Poztﬂk skorunun hesaplanması.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC için görüntü analizi

algoritmasının TC'yi tespit etme yolu ve skorun hesaplanma

şekli:

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması

TC'y renk, yoğunluk, boyut ve morfolojk özellkler kullanarak

saptar.

• Tanımlanan TC, tespt edlen membran ve VENTANA PD-L1

(SP263) Assay yöntem belgesne göre önceden ayarlanan eşk

değerler kullanılarak boyanmış olarak sınıﬂandırılır.

• Boyanmış TC yüzdesnn hesaplanması çn VENTANA PD-L1

(SP263) Assay yöntem belges uyarınca boyanmış TC sayısı

toplam TC sayısına bölünür.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC için görüntü analizi

algoritması beyaz boşluk tespiti:

• Algortma beyaz boşlukları otomatk olarak harç tutar. Kr,

çzkler veya mürekkep gb artefaktlar otomatk olarak harç

bırakılmayablr.

• Kullanıcı algortma tarafından beyaz boşluk olarak tespt edlen

alanları yanlış renk kaplaması kullanarak nceleyeblr; bkz.

"PD-L1 Görüntü Analz: Yanlış Renk Kaplaması".

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC için görüntü analizi

algoritmasının TC pozitiﬂik skoru çıktısını oluşturma

kriterleri:

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

"%4,8" gb onda brler basamağında br hane olacak şeklde

skor raporlayacaktır.

• Skorun yukarı veya aşağı yuvarlanması tavsye edlmez.

Örneğn "%4,8" değer %5 olarak yuvarlanmamalıdır.

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 5

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay çn çalışmak üzere tasarlanmıştır.

Test sonuçları ancak görüntülenen IHC slaytının kalte ve

doğruluğu ve daha sonra analz edlen görüntü kadar doğrudur.

Patolog, slayt görüntülernn analz çn uPath enterprse software

yazılımına grşnden önce beklenen sonuçların elde edldğn

doğrulamak çn PD-L1 kontrol slaytlarını mkroskopla manuel

olarak nceleyerek VENTANA PD-L1 (SP263) Assay boyama

şlemn onaylamalıdır.

Her br boyama şlemndek tüm poztf ve negatf kalte kontrol

materyaller dahl olmak üzere üretcnn VENTANA PD-L1 (SP263)

Assay le lgl önerlernden yararlanın. Manuel mkroskopk

ncelemeyle kontrol slaytları kabul edleblr değlse dokuyu kabul

edleblr sonuçlarla tekrar boyayın.

Patolog VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yorumlamasına yönelk

tavsyelere uymalıdır.

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belgesne (P/N

1014258EN) ve yorumlama kılavuzuna (P/N 1015317EN) bakın

(www.ventana.com adresnde mevcuttur).

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

hstolojk tetkk, lgl klnk blgler ve uygun kontroller le brlkte

kalfye br patolog tarafından kullanım çn tasarlanmıştır.

Bağımsız br araç olarak tasarlanmamıştır ve analz sürec boyunca

yetkn nsan müdahales gerektrr.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

alınan görüntülerde anormal boyama bulunması halnde

(nükleer, stoplazma, vb.) yanlış skorlar oluşturablr.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

hücrenn genel şekl ne olursa olsun uzamış tümör nükleuslarını

reddeder. Bu nedenle, uzamış nükleusu bulunan çok sayıda hücre

çeren tümörlern manuel olarak değerlendrlmes gerekeblr.

Sınırlamalar

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması,

NSCLC doku örnekler üzernde eğtlmş, gelştrlmş ve

doğrulanmıştır.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortmasının

evden kşsel blgsayarla (personal computer, PC) kullanımı test

edlmemş veya güvenlğ ve etknlğ onaylanmamıştır.

uPath PD-L1 SP263 görüntü analz algortması onaylı terapötk

ürün etketlemes uyarınca %50 PD-L1 TC poztﬂk kesme

noktasına sahp teraplerle tedavye yönelk olarak NSCLC

hastalarının saptanmasında kullanım çn endkedr.

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması

zayıf stoplazmk ve/veya membranöz boyama, öneml derecede

karışık enﬂamasyon olan durumlarda tümör hücres boyamasıyla

örtüşen güçlü mmün hücre boyaması, stoplazmk belrgnleşme

görülen TC ve hedef dışı boyama varlığından ötürü hücreler yanlış

tespt edeblr. Bu durum yanlışlıkla TC'nn TC dışı olarak, TC dışı

unsurların se poztf TC olarak saptanmasıyla sonuçlanablr.

Her ne kadar analz bölgesnden makrofajların harç tutulması

gerekse de, tüm makrofajları harç tutmak her zaman mümkün

değldr. Bunun sonucu olarak uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn

görüntü analz algortması tarafından oluşturulan skor analz

edlen ROI çndek makrofajlardan etkleneblr. Hasta skorunun

%50 kesme noktasına yakın olduğu durumlarda bu krtktr.

Stoplazmk boyama nce, granüler br özellk gösteren bazı

vakalarla brlkte genel olarak dağınıktır. Nadr vakalar değşken

yoğunlukla brlkte pernükleer, nokta benzer gövde boyaması

göstermştr. Tümör membran snyal yoğunluklarının toplam

yüzdes görsel olarak hesaplanır ve PD-L1 ekspresyon sevyesn

oluşturmak çn kullanılır. Tümör hücres stoplazmk boyaması

PD-L1 ekspresyonunun belrlenmesnde dkkate alınmaz. Test

örneklernde arka plan varlığını değerlendrmek ve boyama

yoğunluğu temel belrlemek çn zotp eşleştrlmel negatf br

kontrol antkoru kullanılır.

6 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Veri Güvenliği

Kötü amaçlı yazılım veya yetksz chaz erşm, ver kaybına veya

chazın kullanılamaz duruma gelmesne yol açablr.

Kötü amaçlı yazılım bulaşmasını veya yetksz erşm ve chazın

yanlış kullanımını önlemek çn aşağıdak önerler son derece

önemldr:

• Chazda başka br yazılım yüklemeyn veya çalıştırmayın.

• Ağ üzerndek dğer blgsayar ve hzmetlern güvenlğnn

düzgün şeklde sağlandığından ve kötü amaçlı yazılımlar le

yetksz erşme karşı korunduğundan emn olun. Örneğn,

laboratuvar blg sstem (LIS), arşv paylaşımı, yedek paylaşımı

veya servs.

• Müşterler, özellkle kötü amaçlı yazılım ve saldırılara karşı

koruma olmak üzere kend yerel alan ağlarının güvenlğnden

sorumludur. Bu koruma, chazı kontrolsüz ağlardan ayırmak

çn güvenlk duvarı gb önlemler çereblr. Bu koruma ayrıca

bağlı ağın kötü amaçlı kod çermedğnden emn olmaya

yönelk önlemler çereblr.

• Chaza ve tüm bağlı BT altyapılarına (blgsayarlar, kablolar, ağ

ekpmanları vb.) fzksel erşm kısıtlayın.

• Chaz yedek ve arşv dosyalarının yetksz erşmden ve

olağanüstü durumlardan korunduğundan emn olun. Bu lste

uzak depolama konumu, olağanüstü durum bulma steler ve

yedek dosyaların güvenl aktarımını çerr.

• Mümkünse ağ trafğn kısıtlamak çn br güvenlk duvarı

kullanın.

• USB ﬂaş bellekler çeştl türde yedekleme ve ger yükleme

şlemler çn kullanılablr. USB ﬂaş belleğn yanlış kullanımı,

ver kaybına veya chazın arızalanmasına yol açablr.

• Yalnızca yerel Roche servs temslcnz tarafından test edlen

ve kurulan USB ﬂaş bellekler kullanın.

• Br defada yalnızca br USB aygıtı kullanılablr. USB ﬂaş belleğ

takmadan önce başka br USB aygıtının takılı olmadığını

kontrol edn.

• USB ﬂaş belleğ çıkarmadan önce Wndows şletm sstemnde

Eject (Çıkart) düğmesn seçn.

• Sunucu le brlkte sağlanan varsayılan şletm sstem (OS)

yapılandırması, güvenl hale getrlmş OS yapılandırmalarını

etklememek çn değştrlmemeldr.

• uPath enterprse software yazılımına vrüs bulaşmasını

önlemek çn USB ﬂaş belleğ yalnızca chazda kullanın. Bu

USB ﬂaş bellekte başka verler saklamayın.

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 7

uPath PD-L1 NSCLC için görüntü analizi Algoritması kullanımına yönelik iş akışı

Gerekli materyaller

• uPath enterprse software

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması

• BenchMark ULTRA chazı üzernde VENTANA PD-L1 (SP263) Assay (OptVew DAB IHC Detecton Kt kullanılarak) boyanan NSCLC

doku slaytları

• VENTANA DP 200 slayt tarayıcısı

İş Akışı

1. Cam slayt üzernde br NSCLC doku örneğ VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le br BenchMark ULTRA chazı kullanılarak boyanır.

2. Görüntü çekm (tam slayt taraması), br z düzlemnde 20x büyütme sevyesnde VENTANA DP 200 slayt tarayıcısı le gerçekleştrlr.

3. Djtal görüntüler alındıktan sonra bu görüntüler, VENTANA DP 200 slayt tarayıcısı le lşkl blgsayardan merkez sunucudak

görüntü yönetm sstemne (IMS) aktarılır.

4. Sunucuya aktarımın ardından uPath enterprse software yazılımında br vaka oluşturulur. Vaka oluşturma, cam slaytın barkod

etketnde yer alan tanımlama blgler (doku tp ve brncl antkor) kullanılarak laboratuvar blg sstem (LIS) le letşm yoluyla

otomatk olarak gerçekleştrleblr veya uPath enterprse software yazılımına manuel olarak grleblr (uPath enterprse software

Kullanıcı Kılavuzu (PN 1018943TR) belgesne bakın).

5. uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması kuruluysa (uPath enterprse software ve IMS dışında farklı br

sunucuya kurulmalıdır) ve uygun boya ve doku tpne sahp 20x sevyesnde büyütülmüş br görüntü yazılıma grlmşse uPath

enterprse software, Tam Slayt Analzn (Whole Slde Analyss, WSA) otomatk olarak tetkler.

6. WSA, taranan görüntünün tamamını otomatk olarak analz eder.

7. WSA tamamlandığında, uPath enterprse software çnde patoloğa "analyss s complete" (analz tamamlandı) bldrm yapılır.

Patolog artık skorlanacak spesfk ROI'ler seçeblr. Patolog herhang br boyutta tek br ROI veya brden fazla ROI seçeblr. Brden

fazla ROI seçlrse her br ROI çn ayrı br skorun yanı sıra toplu br skor da sunulur.

Boyama

• Doku hazırlama ve boyama şlemlernde, VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belgesnde verlen önerler zlenmeldr.

• Tüm uygun kontroller gözden geçrlmel ve boyama, VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belgesnde belrtlen kurallara uygun

değlse slaytlar yenden boyanmalıdır.

• uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması, dokuları analzden önce boyamak çn VENTANA PD-L1 (SP263)

Assay ürününün ve VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belgesnde varsa lstelenmş ek materyal veya gerekl malzemelern

kullanımını gerektrr. VENTANA PD-L1 (SP263) Assay, BenchMark ULTRA chazında OptVew DAB IHC Detecton Kt le boyanan

FFPE NSCLC dokusundak PD-L1 protenn tespt eder. Her ne kadar VENTANA PD-L1 (SP263) Assay tarafından BenchMark

ULTRA chazlarında boyanan FFPE NSCLC dokudak PD-L1 proten saptansa da, uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortması BenchMark ULTRA chazında boyanan OptVew DAB IHC Detecton Kt kullanılarak doğrulanmıştır.

Görüntü Alma

Slaytların taranması çn VENTANA DP 200 slayt tarayıcısı gerekldr. Görüntülern 20x büyütme sevyesnde taranması gerekr.

Görüntünün büyük kısımları ﬂu se slaytların yenden taranması önerlr. Tarama hakkında daha fazla blg çn lütfen VENTANA DP 200

slayt tarayıcısı Kullanıcı Kılavuzu (PN 1017149TR) belgesne bakın.

Genel Navigasyon: uPath enterprise software

uPath enterprse software yazılımının kşsel gereksnmler ve tess gereksnmler doğrultusunda, rapor yapılandırması ve kullanıcı

arayüzü dahl ancak bunlarla sınırlı olmamak üzere özelleştrlmes amaçlanmıştır. Bu Algortma Kılavuzu, yalnızca uPath PD-L1 (SP263)

NSCLC çn görüntü analz algortmasının kullanımı çn gerekl araçlara odaklanmaktadır. uPath enterprse software hakkında daha

fazla blg çn lütfen uPath enterprse software User Gude belgesne bakın.

8 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Patolog İş Akışı

Bir Vaka Açma

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le boyanan NSCLC dokusu görüntülerne br vakaya çft tıklayarak veya br vaka seçp uPath enterprse

software çndek vewer (görüntüleyc) sekmesne basarak erşleblr (Şekl 1).

Br vaka le lşkl tüm görüntülern bulunduğu br ekran görüntülenr (Şekl 2).

Şekil 2

Şekil 1

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 9

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le boyanmış br slayt, VENTANA DP 200 slayt tarayıcısında 20x büyütme sevyesnde tarandıktan sonra

görüntü, uPath enterprse software yazılımına aktarılır ve br vaka le lşklendrlr. uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz

algortması, WSA şlemn otomatk olarak tetkler. WSA ön hesaplama adımının tamamlanması çn gerekl süre, sunucu özellklerne,

görüntü boyutlarına ve sırada bulunan görüntü sayısına bağlıdır. "Watng to start auto-analyss" (Otomatk analzn başlatılması

beklenyor) mesajının görüntülenmes, görüntülern sırada olduğunu ve henüz analz edlmedğn gösterr. "analyzng" (analz edlyor)

mesajı se WSA gerçekleştrlrken gösterlr (Şekl 3 ve 4). Görüntü, uPath enterprse software yazılımında WSA aracılığıyla tamamen

analz edldkten sonra, uPath enterprse software yazılımındak vewer (görüntüleyc) alanında, slayt görüntüsünün altında "analyss

successful" (analz başarılı) mesajı görüntülenr (Şekl 5). Görüntüler, WSA başarılı br şeklde tamamlanmadan önce skorlanamaz.

Tam Tümör ROI'lerini Çizme: Tümör Alanını Seçme

Analz edlecek IHC slayt görüntüsündek tümör alanlarını seçmek çn ROI açılır menüsündek (Şekl 6) Freehand (Serbest Çzm) aracı

düğmesn kullanın. Şekl 7'de, tek br ROI'nn çzl olduğu br görüntü gösterlmektedr. İlave ROI'ler çzleblr. Seçlen her alan, Slde

Panel (Slayt Panel) alanında br ROI görünmesne neden olur (Şekl 8).

Şekil 6 Şekil 7

Şekil 8

Şekil 5

Şekil 4

Şekil 3

10 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Tam Tümör ROI'lerini Çizme: Hariç Tutma Alanı

ROI'ler çzerken belrl alanların harç tutulması gerekl olablr. Kaçınılacak veya dışarıda bırakılacak belrl alanlar ve bunların örnekler,

aşağıdak boyama özellkler bölümünde ele alınacaktır. Belrl alanları harç tutmak çn (Şekl 10) Excluson (Harç Tutma) açılır menüsünde

bulunan Freehand (Serbest Çzm) harç tutma aracını (Şekl 9) kullanın. Görüntünün büyük kısımları bulanık veya ﬂu se slaytı yenden tarayın.

Harç tutulan alanlar algortma tarafından analz edlmez ve bu alan çndek boyanmış ve boyanmamış TC toplam analz alanından harç

tutulur. ROI önceden analz edlmş ve harç tutma kullanılmışsa ROI'nn yenden analz edlmes ve kaplama le skorun uygun şeklde

güncellenmes gerekr.

Özellkle karmaşık Freehand (Serbest Çzm) harç tutmaları olmak üzere yüksek sayıda harç tutma çzmek çok zaman alablr ve ş akışı

vermn nha skora yalnızca çok az etk edecek şeklde etkleyeblr. Br vakanın yüksek sayıda harç tutma gerektrmes durumunda

patolog aşağıdakler yapmalıdır:

• Brden fazla ROI çzmek ve skorlanamaz kabul edlen doku bölümlern Excluson (Harç Tutma) aracını mnmum sevyede

kullanarak harç tutmak.

• Harç tutmaları sınırlamak ve skoru başka br skorla manuel olarak geçersz kılmak.

Tam Tümör ROI'lerini Çizme: Silme

Seçlen br tam tümör ROI's optmum değlse slneblr. Görüntü üzernde ROI'nn merkezne tıklayarak ve ardından Slde Panel (Slayt

Panel) çndek (Şekl 11) veya slayt görüntüsü çnde ROI'nn yakınındak (Şekl 12) Delete (Sl) düğmesne tıklayarak tam tümör ROI'sn

seçn. Br onay penceres görüntülenr. Seçlen ROI'y slmek çn Confrm (İşlem Onayla) öğesn seçn. ROI'y tutmak çn Cancel (İptal)

öğesn seçn.

Şekil 10Şekil 9

Şekil 11 Şekil 12

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 11

Tüm tam tümör ROI'ler ve/veya harç tutulacak alanlar çzldkten sonra görüntü analz edlmeye hazırdır. Analz edlecek ROI'nn

merkezne veya Slde Panel (Slayt Panel) çnde ROI üzerne tıklayarak tam tümör ROI'sn seçn. Her br ROI çn Slde Panel (Slayt Panel)

çndek (Şekl 13) veya ROI'nn yanındak (Şekl 14) Image Analyss (Görüntü Analz) düğmesn seçn.

PD-L1 Analz tamamlandıktan sonra sonuç, Slde Panel (Slayt Panel) çnde k konumda görüntülenr: Slde Score (Slayt Skoru)

öğesnn altında ve ROI'lern yanında (Şekl 15). Slde Score (Slayt Skoru), seçlen tüm ROI'ler genelnde tümör hücres poztﬂğ

durumunun br toplamına dayalı olup raporda görünecek olan skordur.

PD-L1 Görüntü Analz

Şekil 15

Ayrıca, döner panel smgesne (Şekl 16) tıklayarak Slde Score (Slayt Skoru) döner panelnde ve ROI Detals (ROI Ayrıntıları) döner

panelnde daha ayrıntılı blgler bulablrsnz. Slde Score (Slayt Skoru) döner panel görüntülenr (Şekl 17). Aynı döner panel smgesne

tıklandığında bu blgler gzlenr.

Şekil 17

Şekil 16

Şekil 13 Şekil 14

12 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

PD-L1 Görüntü Analizi: Yanlış Renk Kaplaması

ROI(s) Analyss (ROI Analz) düğmesne basılıp doku analz edldkten sonra ROI üzernde br renk kaplaması görüntülenr. Aşağıdak

görüntüde (Şekl 18), kırmızı dareler PD-L1 açısından poztf olarak boyandığı belrlenmş hücreler, mav dareler se PD-L1 açısından

negatf olarak boyandığı belrlenmş hücreler temsl etmektedr. Görüntü tutulduğunda (fareyle sol tıklanıp görüntü hareket

ettrldğnde) kaplama kaybolur (Şekl 19). Fare düğmes bırakıldığında kaplama tekrar görünür (Şekl 18).

Şekil 18

Şekil 19

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 13

Slayt Skoru Girişini Manuel Olarak Geçersiz Kılma

Skorlar, Slde Panel (Slayt Panel) çnde Slde Score (Slayt Skoru) öğesnn yanında bulunan Slde Score (Slayt Skoru) döner panel

smgesne tıklanarak manuel olarak geçersz kılınablr (Şekl 16). Slde Score (Slayt Skoru) döner panel görüntülenr (Şekl 20). Slde

Score (Slayt Skoru) döner panelnde Edt (Düzenle) düğmes (Şekl 20) seçldğnde kullanıcı, manuel br skor yazablr (Şekl 21).

Comments (Yorumlar) alanı, vakaya ve/veya otomatk skoru geçersz kılma kararına lşkn notlar alınmasını sağlar. PD-L1 çn %0-100

arası skorlar manuel olarak grleblr. Manuel Geçersz Kılma skorunu grdkten sonra Confrm (İşlem Onayla) düğmesn (Şekl 22)

seçn. Br onay mesajı görüntülenr; "Yes" (Evet) öğesne tıklayın.

Slde Panel (Slayt Panel) çndek skor artık manuel geçersz kılma skorunu gösterr. ROI'lern yanında sunulan görüntü analz skoru artık

mevcut değldr (Şekl 23). Kullanıcı, çubuk grafk düğmesne (Şekl 13, Şekl 14) basarak görüntüyü yenden analz etme seçeneğne

sahptr.

Şekil 21 Şekil 22

Şekil 20

Şekil 23

14 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Lütfen VENTANA PD-L1 (SP263) Assay yöntem belgesne ve Yorumlama Kılavuzuna bakın.

PD-L1 Değerlendrmes

VENTANA PD-L1 (SP263) Assay le etketl NSCLC neoplastk hücreler herhang br yoğunlukta membran boyaması le TC yüzde

poztﬂğ açısından değerlendrlr. NSCLC'de mmünohstokmyasal boyama membranöz ve/veya stoplazmktr ve neoplazma

genelnde homojen veya heterojen br şeklde eksprese olablr. Tümör hücres stoplazmk boyaması, TC poztﬂk skoru hesaplamasında

dkkate alınmaz. Membran boyaması kesntl, çevresel veya bazolateral paterne sahp olablr. Test örneklernde arka plan varlığını

değerlendrmek çn zotp eşleştrlmel negatf br kontrol antkoru kullanılır.

PD-L1 Algortması Boyama Değerlendrmes

uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortmasını kullanan patolog VENTANA PD-L1 (SP263) Assay ürününü manuel

olarak skorlamaya lşkn blg sahb olmalıdır. Patolog, tam tümör alanının etrafına dare çzmek çn freehand (serbest çzm) aracını

kullanmalıdır. Patolog, uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortmasını kullanmadan önce, lşkl H&E ve negatf kontrol

slaytına referans vermeldr. Analz edlecek alanları seçerken lütfen Sınırlamalar ve Kaçınılması gereken alanlar bölümlernde açıklanan

sınırlamaları dkkate alın. Patolog, uPath PD-L1 (SP263) NSCLC çn görüntü analz algortması tarafından sağlanan skoru kabul etmezse

skoru manuel olarak geçersz kılmalıdır.

Değerlendrleblr olmayan vakalar, bunlarla sınırlı olmamak üzere, yetersz canlı tümör bulunduran, morfolojs kabul edleblr olmayan

ve engelleyc br arka planı bulunan vakaları çerr. Yeterl mktarda canlı TC'nn bulunduğu (skorlayan patolog tarafından belrlendğ

şeklde) ve PD-L1 IHC slaytında arka planın engelleyc olmadığı NSCLC vakaları değerlendrme çn kabul edleblr.

Boyama Özellikleri

uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu 15

Şekil 24: uPath enterprse software yazılımında IHC olarak boyanmış NSCLC dokusuna at taranmış görüntüler; analzden

önce (yukarıda) ve analzden sonra (aşağıda). Kırmızı kaplama poztf olarak boyanmış TC olduğu belrlenen hücreler, mav

kaplama se negatf olarak boyanmış TC olduğu belrlenen hücreler temsl eder.

Aşağıdak Şekllerde (24-25) çeştl boyama paternlerne ve PD-L1 ekspresyon sevyelerne sahp görüntüler verlmektedr. TC çnde

PD-L1 ekspresyonu yüzde olarak raporlanır (0-100).

16 uPath PD-L1 (SP263) Küçük Hücrel Olmayan Akcğer Kanser (NSCLC) çn görüntü analz Algortma Kılavuzu

Sayfa yükleniyor...

Roche uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm Kullanım kılavuzu

Marka: Roche

Modeli: uPath PD-L1 image analysis for NSCLC IVD Algorithm

Tip: Kullanım kılavuzu

PDF''yi indir

rapor

İlgili makaleler

Diğer belgeler

3M Molecular Detection Assay 2 - Campylobacter MDA2CAM96, 96 tests, 1 ea Kullanma talimatları